Как сообщает THE TECH, компания Radical Numerics впервые применила в клинической практике бактериофаги, сконструированные искусственным интеллектом. Экспериментальное лечение провели у пациента с бактериальной инфекцией, на которую не действуют антибиотики.
Бактериофаги — это вирусы, заражающие бактерии. В отличие от антибиотиков широкого спектра действия, они работают прицельно — против конкретных бактерий — и щадят значительную часть полезной микрофлоры. «Коктейль» таких вирусов, созданный ИИ, сначала проверили в лаборатории: он уничтожил устойчивый к антибиотикам штамм, взятый у пациента, после чего терапию применили по программе гуманитарного использования под контролем врачей.
Фаги для терапии создаёт ИИ-модель Omnii-1, обученная анализировать генетические последовательности и то, как вирусы взаимодействуют с бактериями. Модель генерирует новые варианты фагов и предсказывает, какие из них сработают против нужных штаммов, — это ключ к персонализированной фаготерапии, при которой лечение подбирают под бактерии конкретного пациента. Сейчас поиск подходящих фагов держится на лабораторных проверках коллекций вирусов и отнимает много времени, особенно при устойчивости инфекции к нескольким антибиотикам, и ИИ может заметно ускорить этот этап.
Возможности модели проверяли на бактериофаге T7, поражающем кишечную палочку E. coli. При внесении 11–15 аминокислотных замен в последовательность вируса жизнеспособными удалось получить 69,9% созданных моделью фагов — против 4,8% у случайно изменённых контрольных вариантов. Из 100 отобранных моделью кандидатов против двух штаммов бактерий порог активности, заданный исследователями, превысили 97 и 96 фагов соответственно.
Radical Numerics не раскрывает состояние пациента и итоги лечения, ссылаясь на конфиденциальность. По словам компании, терапия не одобрена для широкого клинического применения, один случай не позволяет судить о безопасности и эффективности метода, а лабораторные результаты Omnii-1 не доказывают действенность лечения у людей. Дальше компания планирует развивать Omnii-1 и сотрудничать с исследователями, клиниками и медицинскими центрами.
Значимость темы — в росте устойчивости бактерий к антибиотикам: по данным исследования Global Burden of Disease, опубликованного в The Lancet, в 2021 году с ней были связаны около 4,7 млн смертей во всём мире, а на период с 2025 по 2050 год прогнозируется почти 40 млн таких смертей. Фаги рассматривают как один из подходов к лечению таких инфекций, когда стандартная терапия не помогает.
